Ο συνολικός προϋπολογισμός της Στρατηγικής ΒΑΑ ανέρχεται σε 80.300.000€.
Η Στρατηγική βασίζεται κατά κύριο λόγο σε πόρους του ΠΕΠ Ηπείρου 2014-2020 οι οποίοι θα χρηματοδοτήσουν έργα α’ και β’ προτεραιότητας καθώς και έργα τεχνικής βοήθειας. Λοιπές πηγές χρηματοδότησης της Στρατηγικής αποτελούν:\r\n
- Τομεακά Επιχειρησιακά Προγράμματα όπως ΕΠ «Υποδομές Μεταφορών, Περιβάλλον και Αειφόρος Ανάπτυξη», «Ανταγωνιστικότητα, Επιχειρηματικότητα, Καινοτομία», Πρόγραμμα Αγροτικής Ανάπτυξης 2014-2020\r\n
- Προγράμματα Εδαφικής Συνεργασίας και δη το Πρόγραμμα Διασυνοριακής Συνεργασίας Interreg IPA II «Ελλάδα – Αλβανία 2014-2020»
- Προγράμματα της ΕΕ, όπως:
- Ευρωπαϊκό Πρόγραμμα URBACT, το οποίο διευκολύνει τις πόλεις να συνεργάζονται και να αναπτύσσουν ολοκληρωμένες λύσεις σχετικά με τοπικές προκλήσεις.
- Ευρωπαϊκή Πρωτοβουλία Urban Innovative Actions (UIA) η οποία προσβλέπει στη διερεύνηση νέων προσεγγίσεων και αντιμετώπισης των προκλήσεων που αντιμετωπίζουν οι αστικές αρχές για θέματα που σχετίζονται με ενέργεια, αστική φτώχεια, ενδυνάμωση του τοπικού πληθυσμού.
Τέλος, σημειώνεται ότι πέραν των παραπάνω θα επιδιωχθεί και η μόχλευση πόρων από τον ιδιωτικό τομέα.